Ukuran bakteri bervariasi. Pada umumnya bakteri berukuran lebih kecil dibandingkan makluk hidup eukariotik atau hanya berkisar antara 0,5-5 mikron. Namun, ada juga bakteri yang berukuran lebih besar dari sel eukariotik yakni Epulopiscium fishelsoni dan Thiomagarita sp. Pada gambar di atas adalah Epulopiscium fishelsoni yang berukuran lebih kurang 0,5 mm. Bakteri ini adalah bakteri gram positif yang biasanya hidup bersimbiosis dengan ikan. Epulopiscium fishelsoni bersifat heterotrof.
Jadi nama spesies bakteri pada gambar adalah Epulopiscium fishelsoni.
*Bacillus cereus adalah bakteri kecil dengan ukuran 1 – 1,2 mikron.
*Thiomagarita sp. adalah bakteri dengan ukuran terbesar sekitar 0,7 mm.
*Mycoplasma sp. adalah bakteri kecil dengan ukuran 0,12 mikron.
*Rhodospirillum rubrum adalah bakteri kecil dengan ukuran 800 sampai 1.000 nanometer.