Tumbuhan monokotil dan dikotil memiliki beberapa perbedaan dari struktur organ atau bagian tubuhnya. Salah satunya adalah perbedaan pada jumlah keping biji. Tumbuhan monokotil (mono artinya satu dan kotiledon artinya biji atau keping) memiliki keping biji berjumlah satu (tunggal). Sedangkan tumbuhan dikotil (di artinya dua) memiliki keping biji berjumlah dua.

Masing-masing biji pada tumbuhan monokotil dan dikotil dilapisi atau dilindungi oleh daun buah. Daun buah ada yang berbentuk tebal, misalnya pada mangga dan semangka, atau berupa kulit yang tipis, misalnya pada buncis dan kacang panjang. Oleh karena itu, keduanya dikelompokkan dalam divisi Angiospermae atau tumbuhan berbiji tertutup.

Jadi, dasar pengelompokan tumbuhan monokotil dan dikotil adalah keping biji pada tumbuhan monokotil berjumlah satu (tunggal), sedangkan tumbuhan dikotil berjumlah dua.