Fungsi utama habitat dibagi menjadi dua yaitu:
a. Tempat untuk hidup
Fungsi utama dari habitat yaitu sebagai tempat hidup makhluk hidup. Dengan habitat yang sesuai maka suatu spesies makhluk hidup dapat berkembangbiak, mencari makanan, hingga bertahan hidup.
b. Sebagai tempat perlindungan
Habitat yang cocok bagi suatu spesies makhluk hidup, maka spesies tersebut kemungkinan besar dapat bertahan dari berbagai macam ancaman, misalnya seperti ancaman dari predator atau pemangsa.