Pengelompokkan makhluk hidup pertama kali dilakukan oleh Carolus Linnaeus. Ia menyatakan bahwa organisme yang memiliki banyak persamaan digolongkan dalam tingkatan yang sama. Tingkatan pengelompokan ini disebut dengan takson. Semakin tinggi takson maka persamaannya akan semakin sedikit. Sebaliknya, semakin rendah takson, persamaannya akan semakin banyak.

Urutan tingkat takson dari yang tertinggi hingga terendah adalah kingdom (kerajaan), division (divisi) atau phyllum (filum), classis (kelas), ordo (bangsa), familia (suku), genus (marga), dan species (jenis).

Beberapa contoh kriteria yang menjadi penentu pengklasifikasian tumbuhan adalah

• organ perkembangbiakannya, dengan spora atau bunga;
• habitusnya, termasuk pohon, perdu, atau semak;
• bentuk dan ukuran daun;
• cara berkembang biak, termasuk generatif atau vegetatif.

Jadi yang bukan kriteria pengklasifikasian tumbuhan adalah sistem pernapasan.

*Tumbuhan umumnya tidak memiliki saluran pencernaan makanan karena tumbuhan mampu membuat atau memproduksi makanannya sendiri melalui proses fotosintesis.