Isomer gugus fungsi adalah isomer dengan rumus molekul yang sama tetapi gugus fungsinya berbeda. Pada senyawa turunan alkana terdapat 3 pasangan homolog.
- Alkohol dengan eter yang keduanya memiliki rumus umum CnH2n+2O
- Aldehida dengan keton yang keduanya memiliki rumus umum CnH2nO
- Asam karboksilat dengan ester yang keduanya memiliki rumus umum CnH2nO2
Dari soal, senyawa yang berisomer fungsi adalah senyawa 2 dan 3, yaitu senyawa alkohol berisomer fungsi dengan senyawa eter.
Butanol (C4H10O)

Metoksi propana (C4H10O)

Jadi, pasangan senyawa yang berisomer gugus fungsi adalah senyawa 2 dan 3.